Desenvolvimento e validação do sistema Mining_RNA
DOI:
https://doi.org/10.5335/rbca.v13i3.12285Palavras-chave:
Bioinformática, GEO, Microarranjo, Mineração de Dados, Sistema WEBResumo
O sequenciamento do genoma humano proporcionou o aprofundamento de diversos tipos de estudos e tecnologias de análise biológica, dentre estas, o microarranjo. A necessidade publicar os dados brutos dessas pesquisas impulsionou a criação de bancos de dados públicos onde essas informações pudessem ser indexadas e resgatadas. Essas bases são uma grande fonte de dados transcriptômicos que infelizmente acabam sendo subutilizadas. O objetivo deste trabalho foi o desenvolvimento de um sistema WEB para mineração de dados em estudos transcriptômicos a partir de microarranjos armazenados no banco de dados biológico Gene Expression Omnibus (GEO), o Mining_RNA. Através de uma usabilidade passo-a-passo juntamente com uma série de filtros o sistema possibilita resgatar dados do GEO, calcular a expressão diferencial entre os genes de um estudo, possibilitando ainda análises estatísticas para cada gene do estudo analisado. O sistema foi validado através da comparação com a avaliação dos mesmos dados com o software GEO2R (eficácia aproximada de 98%) e no estudo original (eficácia maior que 90%). Mining_RNA pode ser um forte aliado dos pesquisadores para a reanálise de estudos transcriptômicos, possibilitando uma nova forma de analisar os dados e gerando resultados tão confiáveis quanto ferramentas já consolidadas.
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